Eksplorasi in Silico Senyawa Minyak Atsiri Kemangi (Ocimum x africanum) Sebagai Inhibitor Potensial BCL-2

Latar Belakang: Kanker lambung menyebabkan sekitar 700.000 kematian setiap tahun di seluruh dunia. Terapi konvensional yang digunakan yaitu Venetoclax memiliki efek samping neutropenia, trombositopenia, hingga risiko tumor lysis syndrome (TLS). Tanaman kemangi (Ocimum x africanum) diketahui memiliki kandungan metabolit sekunder sebagai inhibitor B-Cell Lymphoma (BCL-2). Tujuan: penelitian ini untuk mengevaluasi potensi senyawa minyak atsiri kemangi sebagai kandidat inhibitor BCL-2 pada kanker lambung secara in silico. Metode: penelitian ini menggunakan pendekatan in silico terhadap 25 senyawa minyak atsiri kemangi. Struktur senyawa digambar dengan ChemDraw, dioptimasi dengan VegaZZ, validasi metode dengan PyMOL, docking dengan PyRx-AutoDock Vina, pola interaksi residu asam amino dengan BIOVIA, prediksi parameter absorpsi, distribusi, metabolisme, ekskresi (ADME) dengan SwissADME berdasarkan Lipinskis Rules, prediksi toksisitas berdasarkan Cramer Rules dengan ToxTree. Hasil: setelah dilakukan penelitian, hasil menunjukkan tidak ada senyawa yang meniru ikatan hidrogen ligan natif, dengan nilai binding affinity antara -3.7 sampai -6.7 kkal/mol dan nilai RMSD (Root Mean Square Deviation) 1.001 - 1.968 A. Uji parameter ADME menunjukkan 25 senyawa memenuhi persyaratan Lipinski dan 18 senyawa memiliki tingkat toksisitas Class I berdasarkan Cramer Rules. Caryophyllene dipilih untuk dimodifikasi karena nilai binding affinity yang didapat paling negatif yaitu -6.7 kkal/mol yang menunjukkan caryophyllene memiliki ikatan paling baik diantara senyawa lainnya. Caryophyllene dimodifikasi dengan menambahkan gugus -OH menjadi ((1S,9R,E)-6,10-dimethyl-2-methylenebicyclo[7.2.0]undec-5-en-10-yl)methanol dengan nilai binding affinity -6.4, RMSD 1.76 A, ikatan asam amino yang serupa dengan ligan natif, prediksi ADME dan toksisitas sesuai parameter. Kesimpulan: dari penelitian ini yaitu bahwa senyawa minyak atsiri kemangi dapat digunakan sebagai kandidat senyawa obat baru inhibitor BCL-2.